Jistě, sloučit by šly.
Já třeba většinou mám bootstrap a index sloučený (když píšu v Zendu nebo Nette).
Záleží na povaze frameworku, někde si skládáte strukturu sám (Zend, Nette) a tam si píšete index i bootstrap - pak to můžete sloučit (když k tomu máte důvod). V jiném frameworku (CakePHP, Code Igniter) dostáváte sktrukturu předvyplněnou a tam se bootstrap.php hodí.
Odpověď na názor
Odpovídáte na názor k článku Nette Framework: adresářová struktura aplikace.
Pravidla pro diskutující: Přidáním čtenářského příspěvku do diskusí či fóra souhlasíte s pravidly.
Informace o soukromí: U všech přidaných komentářů provozovatel ukládá IP adresu a hostname odesílatele. U neregistrovaných uživatelů se na webu zobrazuje část hostname, případně IP adresy, neumožňující identifikovat konkrétní počítač.
Povolené značky XHTML: a, br, code, em, li, ol, p, pre, strong, sub, sup, ul
