Pokud máte deployment řešet jinak než ručním kopírováním souborů přes ftp, tak skriptem všechny JS (případně i CSS) soubory concatnete a proženete KJSCompressem, jak jsem odkazoval výše. Na ostrém serveru musíte mít konfigurací zajištěno, že se budou vydávat tyto soubory a ne nekomprimované, tedy v šablonách bude nutná nějaká podmínka dle konfigurační direktivy.